本區設置有自然中心、賞鳥小屋、步道、親蟹觀察區、埤塘生態區、海岸林區、北部低海拔林區及水質改善教學區等設施與景觀，將關渡附近從海岸河口到低海拔山區的生態環境，以縮影的方式呈現，適於校外教學與休閒參觀。
- 自然中心：提供生態解說、展示、研究與遊客服務中心。一樓解說大廳設有「關渡生態及人文展」，多媒體演講廳、會議室及紀念禮品區，另提供哺(集)乳室及簡易醫療站服務；二樓設有高倍率賞鳥望遠鏡、學習教室及餐廳。
- 賞鳥小屋：為了避免驚嚇到鳥類，記得「不出聲，聽鳥聲」才能真正體會大自然令人感動的美喔！
- 親蟹觀察區：春季到秋季的退潮時可以觀察到蟹類的洞穴及覓食行為，還有秧雞及雁鴨亦常訪此區。
- 埤塘生態區：在此還原了現今快速消失的靜水域及濕生環境，並營造出飛蜓鳴蛙戲翠池的豐富景象。
- 海岸林區：展現海岸灌木與喬木的植物生態，透過觀察這些植物在保水、抗鹽、繁衍上特化的各種構造，可以了解其如何適應生存於嚴苛的海岸環境。
- 北部低海拔林區：本區的景觀為北台灣海拔三百公尺以下的闊葉林相，其花朶可招蜂引蝶，果實可供多種陸鳥食用，林下的枯木更可提供昆蟲棲息繁衍。
- 水質改善教學區：為了改善受汙染的舊貴子坑溪的溪水而設有污染減量設施及表面流式人工濕地。